Het Natuurmuseum Nijmegen heeft een grote verzameling dieren, planten en stenen uit de regio. Het museum wil door verrassende, interactieve tentoonstellingen en activiteiten de belangstelling voor natuur bij jong en oud aanwakkeren. In het informatiecentrum voor de Gelderse Poort is van alles te ontdekken over o.a. bevers, geologie en nieuwe natuur. Zo zijn er schedels en botten te zien van oa een wolharige neushoorn en en mammoetschedel van 38900 jaar oud.

Bij het onderdeel Onder onze voeten, is een grondboring van 150 m diep (tot -120 m NAP) toegevoegd in het kader van Nijmegen aan zee. Een stimulerende minitentoonstelling (een paneel) met computerpresentatie, die laat zien dat Nijmegen vroeger zee was maar dat dit door klimaatverandering opnieuw kan gebeuren. Hierbij worden vondsten getoond zoals een trilobiet, haaientanden, walvisbotten en schelpen, die in de buurt van Nijmegen gevonden zijn. In het Natuurmuseum vinden ook bijeenkomsten plaats van de GEA en is diverse keren het Zwerfsteensymposium georganiseerd.